. دانشکده علوم و فنون دریایی، واحد علوم و تحقیقات تهران، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران
چکیده: (4624 مشاهده)
ماهی شیر(Scomberomorus commerson) از خانواده تون ماهیان (Scomberidae) بوده و ازنظر اقتصادی و اکولوژیکی دارای اهمیت زیادی می‌باشد. در این بررسی شناسایی مولکولی و تمایز ژنتیکی این ماهی بر اساس منطقه D-loop ژنوم میتوکندریایی با استفاده از تکنیکHRM-Real Time PCR صورت پذیرفته است. برای این کار، باله پشتی 100 نمونه ماهی شیراز 4 منطقه بوشهر، دوحه، جاسک و کراچی تهیه و پس از استخراج ژنوم آن‌ها با انجام واکنش HRM-Real Time PCR با استفاده از رنگ SYTO 9، گروه‌بندی صورت پذیرفت. سرگروه‌ها برای آب‌های بوشهر در 8 گروه، دوحه 6 گروه، جاسک 9 گروه و کراچی 6 گروه دسته‌بندی شدند و درنهایت پس از بررسی نمونه‌ها، در واکنش نهایی HRM-Real Time PCR، 20 گروه حاصل شد. نمونه‌های منتخب با انجام مجدد واکنش زنجیره‌ای پلیمر از برای تعیین توالی ارسال شدند. نتایج به‌دست‌آمده از تعیین توالی با توالی‌های موجود در بانک ژنی NCBI مقایسه شده و جنس و گونه ماهی شیر S. commerson شناسایی شد. سپس با رسم درخت فیلوژنی توسط توالی‌های به‌دست‌آمده و مشاهده تمایز ژنتیکی، مشخص شد که این تکنیک می‌تواند به‌عنوان یک تکنیک مؤثر در تفکیک و گروه‌بندی نمونه‌ها برای بررسی‌های جمعیتی و سرعت بخشیدن به روند تحقیق مورداستفاده قرار گیرد.
Mansoor Kiaei A, Ghavam Mostafavi P, Fatemi S M, Ki Maram F, Nazemi A. Molecular identification and Genetic assessment of Scomberomorus commerson by mitochondrial DNA D-Loop region in the Persian Gulf, Oman Sea and Arabian Sea using HRM- Real Time PCR. 3 2016; 8 (2) :63-72 URL: http://jmb.ahvaz.iau.ir/article-1-482-fa.html
منصورکیائی آنا، قوام مصطفوی پرگل، فاطمی سید محمدرضا، کی مرام فرهاد، ناظمی علی. شناسایی مولکولی و ارزیابی ژنتیکی ماهی شیر Scomberomorus commerson بر اساس D-Loop ژنوم میتوکندریایی در خلیج‌فارس، دریای عمان و دریای عرب با استفاده از تکنیک High Resolution Melting Real Time PCR. زیست شناسی دریا. 1395; 8 (2) :63-72
