ماهی شیر(Scomberomorus commerson) از خانواده تون ماهیان (Scomberidae) بوده و ازنظر اقتصادی و اکولوژیکی دارای اهمیت زیادی میباشد. در این بررسی شناسایی مولکولی و تمایز ژنتیکی این ماهی بر اساس منطقه D-loop ژنوم میتوکندریایی با استفاده از تکنیک HRM-Real Time PCR صورت پذیرفته است. برای این کار، باله پشتی 100 نمونه ماهی شیراز 4 منطقه بوشهر، دوحه، جاسک و کراچی تهیه و پس از استخراج ژنوم آنها با انجام واکنش HRM-Real Time PCR با استفاده از رنگ SYTO 9، گروهبندی صورت پذیرفت. سرگروهها برای آبهای بوشهر در 8 گروه، دوحه 6 گروه، جاسک 9 گروه و کراچی 6 گروه دستهبندی شدند و درنهایت پس از بررسی نمونهها، در واکنش نهایی HRM-Real Time PCR، 20 گروه حاصل شد. نمونههای منتخب با انجام مجدد واکنش زنجیرهای پلیمر از برای تعیین توالی ارسال شدند. نتایج بهدستآمده از تعیین توالی با توالیهای موجود در بانک ژنی NCBI مقایسه شده و جنس و گونه ماهی شیر S. commerson شناسایی شد. سپس با رسم درخت فیلوژنی توسط توالیهای بهدستآمده و مشاهده تمایز ژنتیکی، مشخص شد که این تکنیک میتواند بهعنوان یک تکنیک مؤثر در تفکیک و گروهبندی نمونهها برای بررسیهای جمعیتی و سرعت بخشیدن به روند تحقیق مورداستفاده قرار گیرد.
بازنشر اطلاعات | |
![]() |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |