استخراج DNA خالص و کافی از ماکرو جلبک‌ها به علت دارا بودن رنج وسیعی از متابولیت­های ثانویه، نحوه اشتباه نمونه­برداری و خصوصیات مرفولوژی کی آن‌ها، معمولاً مشکل است. ازآنجاکه استخراج DNA خالص جهت مطالعات مولکولی از اهمیت ویژه­ای برخوردار است این ­مطالعه باهدف استخراج آسان و ارزان DNA ژنومی باکیفیت و کمیت بالا از نمونه­های ماکرو جلبکی انجام شد. استخراج DNA توسط روش­های فنول-کلروفرم، CTAB و CTAB تغییریافته انجام شد و همچنین نیتروژن مایع جهت خرد کردن نمونه­ها حذف گردید. درروش CTAB تغییریافته، تغییراتی در نسبت حجم بافر استخراج به نمونه، ترکیبات بافر استخراج (افزایش غلظت EDTA، بتامرکاپتواتانول و افزودن PVP و سارکوسیل) ایجاد شد. واکنش PCR بر اساس ژن tufA جهت اطمینان از خلوص DNA انجام شد. در ارزیابی کمی و کیفی DNA استخراجی، نسبت 280/260 نانومتر بین 84/1-7/1 و نسبت 230/260 نانومتر بیشتر از 2 نشان داده‌شده و همچنین غلظت DNA بین 8-5/6 میکروگرم بر میکرو لیتر اندازه­گیری شد. محصولات PCR باندهایی را در محدوده 700-800 جفت باز در ژل آگارز نشان دادند. ارزیابی کمی و کیفی داده­ها، خلوص و میزان بالای DNA استخراج‌شده به روش CTAB تغییریافته نسبت به دو روش دیگر را نشان دادند، به‌طوری‌که نسبت­ها نشان­دهنده عاری بودن DNA از ترکیبات پروتئینی و پلی­فنولی/ پلی­ساکاریدی است. ازآنجاکه آلودگی­های پلی­ساکاریدی و فنولی بازدارنده آنزیم­های واکنش PCR هستند بنابراین نتایج موفقیت‌آمیز واکنش PCR نشان­دهنده خلوص DNA استخراج‌شده و کاربرد آن در مطالعات مولکولی است.DNA استخراج‌شده به روش بهینه‌شده در این مطالعه مناسب جهت مطالعات مولکولی و نگهداری است.