شناسایی مولکولی چهار گونه از شکم پایان سواحل صخرهای خلیجفارس
|
منا ایزدیان  |
گروه تنوع زیستی و ایمنی زیستی، پژوهشکده محیطزیست و توسعه پایدار، سازمان حفاظت محیطزیست، تهران، ایران |
|
چکیده: (2271 مشاهده) |
در این پژوهش شناسایی مولکولی چهار گونه از شکم پایان در آبهای ساحلی خلیجفارس موردبررسی قرار گرفت. بدین منظور از ژنهای میتوکندریایی COI و S rRNA16 استفاده شد. نمونهبرداری در مهرماه 1392 و اردیبهشت و دیماه 1393 در سواحل صخرهای شمال خلیجفارس انجام گرفت و نمونهها مورد شناسایی مورفولوژیک قرار گرفتند و گونههای Planaxis sulcatus، Cerithidea cingulata، Siphonaria savignyi و Onchidium peronii شناسایی شدند. سپس مراحل استخراج DNA با استفاده از پودر chelex و پروتئیناز k، تکثیر قطعه ژنی زیر واحد I سیتوکروم اکسیداز (COI) و S rRNA16 انجام و توالی یابی شدند. درمجموع 6 توالی COI و 3 توالی S rRNA16 متعلق به این گونهها برای اولین بار از منطقه شمالی خلیجفارس گزارش و در بانک ژن به ثبت رسید. آنالیزهای فیلوژنی با استفاده از نرمافزارهای MEGA6 و PAUP و با رسم درختهای فیلوژنی Maximum Likelihood وMaximum Parsimony صورت گرفت. بررسی مولکولی این گونهها نتایجی مطابق با شناسایی مورفولوژیک نشان داد. هر دو قطعه میتوکندریایی در شناسایی تا سطح گونه کارآمد عمل کردند. در این پژوهش دو نوع درخت Ml و MP رسم شده برای نمونهها و آنالیزهای مولکولی با شناسایی مورفولوژیک انجامشده، نتایج یکسانی نشان داد. همچنین نتایج مشابهی از بررسی نشانگرهای COI و
S rRNA16 حاصل شد و تفاوتی در توپولوژی درختهای فیلوژنی رسم شده و نیز نتایجی که از تفسیر آنها استنباط شد، مشاهده نشد. بالا بودن شاخصهای حمایتی گرههای پایه در آنالیزهای انجامشده، اثباتی بر آن است که قطعه ژنی COI، نشانگری مطلوب برای ارزیابی و حل فرضیههای تکاملی میباشد.
|
|
واژههای کلیدی: Planaxis sulcatus، Cerithidea cingulata، Siphonaria savignyi و Onchidium peronii، COI، S rRNA16، خلیجفارس. |
|
متن کامل [PDF 365 kb]
(1884 دریافت)
|
نوع مطالعه: پژوهشي |
موضوع مقاله:
شیلات دریافت: 1398/12/7 | پذیرش: 1398/12/7 | انتشار: 1398/12/7
|
|
|
|
|
ارسال نظر درباره این مقاله |
|
|