<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Marine Biology</title>
<title_fa>زیست شناسی دریا</title_fa>
<short_title>3</short_title>
<subject>Basic Sciences</subject>
<web_url>http://jmb.ahvaz.iau.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2322-1410</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online></journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi></journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid></journal_id_sid>
<journal_id_nlai></journal_id_nlai>
<journal_id_science></journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1395</year>
	<month>12</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2017</year>
	<month>3</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>8</volume>
<number>4</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>آنالیز فیلوژنتیک و تعیین الگوی آنتی‌بیوتیکی استرین‌های اشریشیا کلی جداشده از سواحل منطقه گناوه</title_fa>
	<title>Phylogenetic analysis and antibiotic pattern determination of isolated Escherichia coli from water and Shoreline of Genaveh province</title>
	<subject_fa>شیلات</subject_fa>
	<subject>Fisheries</subject>
	<content_type_fa>پژوهشي</content_type_fa>
	<content_type>Research</content_type>
	<abstract_fa>&lt;p dir=&quot;RTL&quot; style=&quot;text-align:justify;direction:rtl;unicode-bidi:embed;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;اشرشیاکلی متعلق به گروهی از باکتری&#8204;ها به نام گروه کلی فرم &lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;هستند که آن&#8204;ها عضوی از خانواده انتروباکتریاسه می&#8204;باشند. این باکتری برای سال&#8204;ها به&#8204;عنوان شاخص مدفوعی برای سلامت عمومی در نظر گرفته&#8204;شده است&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;. اشرشیاکلی به&#8204;عنوان یک ارگانیسم اصلی در انتشار&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;مقاومت آنتی&#8204;بیوتیکی&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;شناخته&#8204;شده&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;است. بر همین اساس هدف از تحقیق حاضر جداسازی سویه&#8204;هایی از این باکتری از سواحل بندر گناوه و رسوبات آن است که به&#8204;وسیله روش کلرمونت ازنظر ژنتیکی طبقه&#8204;بندی گردد و به دنبال آن الگوی آنتی&#8204;بیوتیکی و آنزیمی جدایه ها مورد ارزیابی قرار گیرد. در تحقیق حاضر تعداد 60 نمونه (30 نمونه آب و 30 نمونه رسوبات بندر گناوه) در طول خرداد تا شهریور 1394 جمع&#8204;آوری شد. سپس بیشترین تعداد احتمالی &lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;نمونه&#8204;ها ارزیابی گردید و نمونه&#8204;ها بر روی محیط&#8204;های مک کانکی و ائوزین متیلن بلو کشت داده شدند و به کمک رنگ&#8204;آمیزی گرم، آزمون کاتالاز و اکسیداز موردشناسایی قرار گرفتند.&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt; سپس &lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;طبقه&#8204;بندی&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;گروه&#8204;های&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;فیلوژنتیک سویه&#8204;های اشرشیاکلی با استفاده از پرایمر های اختصاصی &lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;chuA&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;، &lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;yjaA&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt; و قطعه &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;TSPE4.C2&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt; انجام شد و الگوی آنتی&#8204;بیوتیکی جدایه ها ارزیابی گردید. از 60 نمونه جمع&#8204;آوری&#8204;شده،6 مورد اشرشیاکلی جداسازی گردید که 5 نمونه مربوط به آب دریا و 1 مورد مربوط به رسوبات بود. بر اساس نتایج آنتی بیوگرام تمامی جدایه ها به جنتامایسن، سفتریاکسون و سفوتاکسیم با میزان 100 درصد حساس بوده و شایع&#8204;ترین گروهای فیلوژنتیک شناسایی&#8204;شده &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;D&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;، &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;B2&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt; و &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;A&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt; بودند.&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;بر اساس یافته&#8204;های این تحقیق می&#8204;توان چنین نتیجه گرفت که مؤثرترین آنتی&#8204;بیوتیک بروی سویه&#8204;های اشرشیاکلی جداشده از این منطقه آنتی&#8204;بیوتیک&#8204;های&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-family:b nazanin;&quot;&gt;سفتریاکسون و سفوتاکسیم بود. بنابراین پیشنهاد می&#8204;گردد در کنار سایر روش&#8204;های درمانی بهتر است از این آنتی&#8204;بیوتیک&#8204;ها در درمان عفونت&#8204;های ناشی از اشرشیاکلی در این منطقه استفاده شود.&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
</abstract_fa>
	<abstract>&lt;em&gt;Escherichia coli&lt;/em&gt; belong to a group of bacteria called coliform which is member of Entrobacteriacea family. For many years, the bacterium are using as fecal indicator for public health. &lt;em&gt;Escherichia coli&lt;/em&gt; are as an important organism which could disseminate antibiotic resistance in water shoreline. Accordingly, the present study tried to isolate the bacterium from Genaveh shoreline and sediments. Then phylogenetically categorized based on Clermont technique and evaluate their antibiotics pattern. For this purpose, 60 samples (30 water and 30 sediment) were collected from water and sediments between April to August 2016. Then the samples were evaluated by MPN technique and for confirmation they were cultivated on MacConkey and Eosin methylene blue agar. After that they were identified using Gram stain, Catalase and oxidase tests&lt;em&gt;. &lt;/em&gt;The phylogenetical analysis of &lt;em&gt;E.coli&lt;/em&gt; was done using set of primers: ChuA, yjaA, TSPE 4.C2 and antibiotic pattern were assessed using antibiogram test. Out of 60 collected samples, 6 samples were identified as &lt;em&gt;E.coli&lt;/em&gt;, 5 from water and 1 from sediments. Based on antibiogram test all of the isolates with 100% were sensitive to Gentamicin, Ceftriaxone and Cefotaxime. The most common phylogenic group was belonging to groups A, B2 and D. Based on elucidated results it could be concluded that the best antibiotic on the isolates were Gentamicin, Ceftriaxone and Cefotaxime.&amp;nbsp; Therefore, suggesting for remedy of gastrointestinal infections caused by &lt;em&gt;Escherichia coli&lt;/em&gt; the selected antibiotics could be use along with other techniques in this geographical area</abstract>
	<keyword_fa>اشریشیا کلی, الگوی مقاومت آنتی‌بیوتیکی, تریپلکس PCR, سواحل بندر گناوه</keyword_fa>
	<keyword>Escherichia coli, Antibiotic pattern, Triplex PCR, Genaveh shoreline.</keyword>
	<start_page>13</start_page>
	<end_page>20</end_page>
	<web_url>http://jmb.ahvaz.iau.ir/browse.php?a_code=A-10-366-2&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name></first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name></last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>رویا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>سرداری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846003776</code>
	<orcid>10031947532846003776</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه آزاد اسلامی، شیراز</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name></first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name></last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>نیما</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>بهادر</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846003777</code>
	<orcid>10031947532846003777</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه آزاد اسلامی، شیراز</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
