fa شناسایی مولکولی و ارزیابی ژنتیکی ماهی شیر Scomberomorus commerson بر اساس D-Loop ژنوم میتوکندریایی در خلیج‌فارس، دریای عمان و دریای عرب با استفاده از تکنیک High Resolution Melting Real Time PCR شیلات Fisheries پژوهشي Research <p class="Abstract" dir="RTL" style="text-align: justify;"><span b="" lang="FA" style="font-family:">ماهی شیر(</span><i><span dir="LTR">Scomberomorus commerson</span></i><span b="" lang="FA" style="font-family:">) از خانواده تون ماهیان </span><span dir="LTR">(Scomberidae)</span><span b="" lang="FA" style="font-family:"> بوده و ازنظر اقتصادی و اکولوژیکی دارای اهمیت زیادی می‌باشد. در این بررسی شناسایی مولکولی و تمایز ژنتیکی این ماهی بر اساس منطقه </span><span dir="LTR">D-loop</span><span b="" lang="FA" style="font-family:"> ژنوم میتوکندریایی با استفاده از تکنیک</span><span dir="LTR" lang="FA"> </span><span dir="LTR">HRM-Real Time PCR</span><span b="" lang="FA" style="font-family:"> صورت پذیرفته است. برای این کار، باله پشتی 100 نمونه ماهی شیراز 4 منطقه بوشهر، دوحه، جاسک و کراچی تهیه و پس از استخراج ژنوم آن‌ها با انجام واکنش </span><span dir="LTR">HRM-Real Time PCR</span><span b="" lang="FA" style="font-family:"> با استفاده از رنگ </span><span dir="LTR">SYTO 9</span><span b="" lang="FA" style="font-family:">، گروه‌بندی صورت پذیرفت. سرگروه‌ها برای آب‌های بوشهر در 8 گروه، دوحه 6 گروه، جاسک 9 گروه و کراچی 6 گروه دسته‌بندی شدند و درنهایت پس از بررسی نمونه‌ها، در واکنش نهایی </span><span dir="LTR">HRM-Real Time PCR</span><span b="" lang="FA" style="font-family:">، 20 گروه حاصل شد. نمونه‌های منتخب با انجام مجدد واکنش زنجیره‌ای پلیمر از برای تعیین توالی ارسال شدند. نتایج به‌دست‌آمده از تعیین توالی با توالی‌های موجود در بانک ژنی </span><span dir="LTR">NCBI</span><span b="" lang="FA" style="font-family:"> مقایسه شده و جنس و گونه ماهی شیر </span><i><span dir="LTR">S</span></i><span dir="LTR">. <i>commerson</i></span><span b="" lang="FA" style="font-family:"> شناسایی شد. سپس با رسم درخت فیلوژنی توسط توالی‌های به‌دست‌آمده و مشاهده تمایز ژنتیکی، مشخص شد که این تکنیک می‌تواند به‌عنوان یک تکنیک مؤثر در تفکیک و گروه‌بندی نمونه‌ها برای بررسی‌های جمعیتی و سرعت بخشیدن به روند تحقیق مورداستفاده قرار گیرد.</span></p> <p class="Abstract">King fish (<i>Scomberomorus commerson</i>) belonging to the family scombridae considered ecologically and economically important fish species. This research was carried out to identify molecular identification and genetic assessment using mtDNA D-Loop via HRM-Real Time PCR. A total of 100 Dorsal fin clip samples of <i>Scomberomorus commerson</i> were sampled from four locations along Persian Gulf (Bushehr & Doha), Oman Sea (Jask) and Arabian Sea (Karachi) and after isolating genomic DNA, HRM-Real Time PCR was conducted with the use of SYTO 9 saturating dye to classify samples. Representative of groups to the waters of Bushehr, Doha, Jask and Karachi were 8, 6, 9 and 6, respectively. Ultimately, 20 groups were identified by using High Resolution Melting Analysis. Representatives of groups were sequenced after conducting anew PCR. The results of sequencing were inferred by performing blast on NCBI and <i>Scomberomorus commerson</i> were identified. Thereafter, distinctions were observed constructing phylogenetic tree via ensued sequences. Likewise, considerations demonstrated that High Resolution melting-Real Time PCR not just could be an effectual technique to accelerate enquiry procedure but, isolate and classify manifold samples for populations enquiry.</p> ماهی شیر, تون ماهیان, خلیج‌فارس, دریای عمان, دریای عرب, HRMA King fish, Scomberidae, Persian Gulf, Oman Sea, HRMA. 63 72 http://jmb.ahvaz.iau.ir/browse.php?a_code=A-10-169-2&slc_lang=fa&sid=1 Ana Mansoor Kiaei آنا منصورکیائی 10031947532846003665 10031947532846003665 No . دانشکده علوم و فنون دریایی، واحد علوم و تحقیقات تهران، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران Pargol Ghavam Mostafavi پرگل قوام مصطفوی 10031947532846003666 10031947532846003666 Yes . دانشکده علوم و فنون دریایی، واحد علوم و تحقیقات تهران، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران Seeid Mohamadreza Fatemi سید محمدرضا فاطمی 10031947532846003667 10031947532846003667 No . دانشکده علوم و فنون دریایی، واحد علوم و تحقیقات تهران، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران Farhad Ki Maram فرهاد کی مرام 10031947532846003668 10031947532846003668 No سازمان تحقیقات شیلات، تهران Ali Nazemi علی ناظمی 10031947532846003669 10031947532846003669 No دانشگاه آزاد اسلامی، تنکابن