<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Marine Biology</title>
<title_fa>زیست شناسی دریا</title_fa>
<short_title>3</short_title>
<subject>Basic Sciences</subject>
<web_url>http://jmb.ahvaz.iau.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2322-1410</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online></journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi></journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid></journal_id_sid>
<journal_id_nlai></journal_id_nlai>
<journal_id_science></journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1403</year>
	<month>4</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2024</year>
	<month>7</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>16</volume>
<number>3</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>تحلیل بازسازی اندام در اکسولوتل با رویکرد یادگیری عمیق چندلایه</title_fa>
	<title>Deep Learning-Based Analysis of Axolotl Limb Regeneration</title>
	<subject_fa>شیلات</subject_fa>
	<subject>Fisheries</subject>
	<content_type_fa>پژوهشي</content_type_fa>
	<content_type>Research</content_type>
	<abstract_fa>&lt;span style=&quot;line-height:2;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:yekanYW;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;direction:rtl&quot;&gt;&lt;span style=&quot;unicode-bidi:embed&quot;&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot; style=&quot;font-size:10.0pt&quot;&gt;بازسازی اندام&#8204;های پیچیده در مهره&#8204;داران بالغ، یکی از چالش&#8204;برانگیزترین مسائل زیست&#8204;پزشکی محسوب می&#8204;شود. در این میان، اکسولوتل&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-size:10.0pt&quot;&gt; (&lt;i&gt;Ambystoma mexicanum&lt;/i&gt;) &lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot; style=&quot;font-size:10.0pt&quot;&gt;به&#8204;عنوان مدلی منحصر&#8204;به&#8204;فرد با توانایی بازسازی کامل اندام&#8204;های حرکتی، نخاع، قلب و مغز، بستری ارزشمند برای مطالعه مکانیسم&#8204;های زیستی بازسازی فراهم کرده است. این پژوهش با هدف تحلیل جامع و چندلایه فرآیند بازسازی اندام در اکسولوتل طراحی شد و بر بررسی دینامیک سلولی، فعالیت مسیرهای سیگنال&#8204;دهی، و تنظیمات ژنتیکی و اپی&#8204;ژنتیکی تمرکز داشت. نمونه&#8204;برداری در فازهای مختلف بازسازی (روزهای 0، 3، 7، 14، 21، 28) انجام شد. مطالعات هیستولوژیک، ایمونوهیستوشیمی، &lt;/span&gt;&lt;i&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-size:10.0pt&quot;&gt;qRT-PCR&lt;/span&gt;&lt;/i&gt; &amp;nbsp;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot; style=&quot;font-size:10.0pt&quot;&gt;و&lt;/span&gt;&lt;i&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-size:10.0pt&quot;&gt; RNA-seq&lt;/span&gt;&lt;/i&gt; &lt;span lang=&quot;AR-SA&quot; style=&quot;font-size:10.0pt&quot;&gt;برای تحلیل بیان ژن&#8204;های کلیدی مانند &lt;/span&gt;&lt;i&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-size:10.0pt&quot;&gt;fgf8&lt;/span&gt;&lt;/i&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-size:10.0pt&quot;&gt;, &lt;i&gt;msx1&lt;/i&gt;, &lt;i&gt;wnt5a &lt;/i&gt;&lt;/span&gt;&lt;i&gt;&amp;nbsp;&lt;/i&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot; style=&quot;font-size:10.0pt&quot;&gt;و&lt;/span&gt;&lt;i&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-size:10.0pt&quot;&gt;notch1&lt;/span&gt;&lt;/i&gt; &amp;nbsp;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot; style=&quot;font-size:10.0pt&quot;&gt;به&#8204;کار رفت. نتایج نشان داد مسیرهای&amp;nbsp;&lt;/span&gt;&lt;i&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-size:10.0pt&quot;&gt;FGF&lt;/span&gt;&lt;/i&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot; style=&quot;font-size:10.0pt&quot;&gt;، &lt;/span&gt;&lt;i&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-size:10.0pt&quot;&gt;Wnt&lt;/span&gt;&lt;/i&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot; style=&quot;font-size:10.0pt&quot;&gt; و&lt;/span&gt; &lt;i&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-size:10.0pt&quot;&gt;Notch&lt;/span&gt;&lt;/i&gt; &lt;span lang=&quot;AR-SA&quot; style=&quot;font-size:10.0pt&quot;&gt;نقش محوری در تشکیل بلاستما و فعال&#8204;سازی سلول&#8204;های بنیادی و پیش&#8204;ساز دارند. همچنین، آنالیز ترنسکریپتومی آشکار ساخت که تنظیم بیان ژن&#8204;ها تحت تأثیر تعامل بین فاکتورهای درون&#8204;زاد، سیگنال&#8204;های محیطی و مکانیسم&#8204;های اپی&#8204;ژنتیکی قرار دارد. یافته&#8204;ها نشان&#8204;دهنده&#8204;ی هماهنگی پیچیده بین ماتریکس خارج&#8204;سلولی، پاسخ&#8204;های ایمنی و مسیرهای سیگنال&#8204;دهی در بازسازی موفق اندام هستند. این مطالعه با ترسیم نمایی دقیق از مکانیسم&#8204;های زیستی بازسازی در اکسولوتل، چشم&#8204;انداز تازه&#8204;ای برای توسعه درمان&#8204;های بازساختی در انسان فراهم می&#8204;سازد و گامی مؤثر در جهت کاربردهای&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-size:10.0pt&quot;&gt; translational &lt;/span&gt;&lt;span lang=&quot;AR-SA&quot; style=&quot;font-size:10.0pt&quot;&gt;زیست&#8204;شناسی بازسازی محسوب می&#8204;شود.&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-size:10.0pt&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:&quot;Times New Roman&quot;,serif&quot;&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&amp;nbsp;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;span style=&quot;line-height:2;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:14px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:Times New Roman;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black&quot;&gt;Regeneration of complex organs in adult vertebrates is one of the most challenging biomedical issues. Among them, the axolotl (Ambystoma mexicanum) as a unique model with the ability to completely regenerate motor organs, spinal cord, heart, and brain has provided a valuable platform for studying the biological mechanisms of regeneration. This study was designed to comprehensively and multi-layeredly analyze the process of organ regeneration in axolotl and focused on investigating cellular dynamics, signaling pathway activity, and genetic and epigenetic regulation. Sampling was performed at different phases of regeneration (days 0, 3, 7, 14, 21, 28). Histological, immunohistochemical, qRT-PCR, and RNA-seq studies were used to analyze the expression of key genes such as fgf8, msx1, wnt5a, and notch1. The results showed that the FGF, Wnt, and Notch pathways play a pivotal role in blastema formation and activation of stem and progenitor cells. Also, transcriptomic analysis revealed that the regulation of gene expression is influenced by the interaction between endogenous factors, environmental signals, and epigenetic mechanisms. The findings indicate a complex coordination between the extracellular matrix, immune responses, and signaling pathways in successful organ regeneration. By drawing a detailed view of the biological mechanisms of regeneration in axolotl, this study provides a new perspective for the development of regenerative therapies in humans and is an effective step towards translational applications of regenerative biology.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&amp;nbsp;</abstract>
	<keyword_fa>اکسولوتل, بازسازی اندام, سلول‌های بنیادی</keyword_fa>
	<keyword>axolotl, organ regeneration, stem cells</keyword>
	<start_page>71</start_page>
	<end_page>80</end_page>
	<web_url>http://jmb.ahvaz.iau.ir/browse.php?a_code=A-10-721-1&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Amirhossin</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Rezazadehshirazi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>امیر حسین</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>رضازاده شیرازی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>amirrezazadehshirazi1347@gmail.com</email>
	<code>10031947532846007649</code>
	<orcid>10031947532846007649</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Faculty of Veterinary Medicine, Islamic Azad University, Kazerun Branch, Fars, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشکده دامپزشکی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد کازرون، فارس، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Sara</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Mehboudi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سارا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>مهبودی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>saramehbudi@gmail.com</email>
	<code>10031947532846007650</code>
	<orcid>10031947532846007650</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Faculty of Nursing, Islamic Azad University, Kazerun, Fars, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشکده پرستاری، دانشگاه آزاد اسلامی، کازرون، فارس، ایران.</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mohammad </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Tarahomi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمد</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>ترحمی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>motarahomi2225@iau.ir</email>
	<code>10031947532846007651</code>
	<orcid>10031947532846007651</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Aquatic Animal Disease Health Group, Faculty of Veterinary Medicine, Islamic Azad University, Kazerun Branch, Fars, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه بهداشت بیماری‌های آبزیان، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد کازرون، فارس، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
